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经典名方现代研究文献的组学信息抽取（SXTCM202500090号）采购公告

全部类型山西太原2025年11月14日

公告详情

项目名称	经典名方现代研究文献的组学信息抽取	项目编号	****
公告开始日期	**** 18:03:06	公告截止日期	**** 20:00:00
采购单位	点击登录查看	付款方式
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预算总价	￥60000.00
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供应商资质要求	符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件
公告说明

采购清单1

采购商品	采购数量	计量单位	所属分类
经典名方现代研究文献的组学信息抽取	1	项

品牌
型号
预算单价	￥ 60000.00
技术参数及配置要求	一、项目目标 1.构建覆盖不少于100首《古代经典名方目录》收录方剂的现代研究文献组学信息资源库，实现对基因、mRNA、蛋白质、代谢物等核心组学实体及实体间关联关系的系统收录，支持数据查询、可视化分析与科研辅助决策。 2.开发针对经典名方研究文献的组学信息智能抽取工具，支持文献批量导入、组学信息自动抽取、人工校对、信息检索与导出等功能，核心组学实体识别准确率不低于90%，关系抽取F1值不低于85%。 3.完成对不少于3000篇经典名方现代研究核心文献的组学信息抽取与校验，形成标准化的组学信息数据集，服务“三结合”审评证据体系建设。 4.提供操作培训及为期不少于1年的技术支持服务，保障系统稳定运行及后续功能优化升级。 5.形成一套适用于中医药文献语义特征的组学信息标注规范与机器学习模型训练流程，具备可持续更新与扩展能力。二、项目核心需求与主要任务（一）文献范围与数据来源文献类型：涵盖中文、英文公开发表的学术论文、学位论文、会议论文、专利文献及临床研究报告等，优先纳入核心期刊论文及SCI收录论文。数据来源：包括中国知网、万方数据、维普网、PubMed、Web of Science、Scopus等国内外主流学术数据库，投标人须具备合法获取相关文献的能力。文献筛选：依据《经典名方研究文献筛选标准》，完成文献的初筛、复筛及质量评估，确保纳入文献与目标名方的关联性及研究质量。（二）组学信息抽取内容核心组学实体：包括但不限于基因（基因名称、基因ID、物种来源）、mRNA（转录本ID、表达水平）、蛋白质（蛋白名称、UniProt ID、表达量）、代谢物（代谢物名称、HMDB ID、浓度信息）、微小RNA（miRNA名称、miRBase ID）等。实体关联关系：包括组学实体与疾病的关联（如基因-疾病调控关系）、组学实体间的相互作用（如基因-蛋白质结合关系）、组学实体与经典名方的关联（如名方对基因表达的影响）等。辅助信息：包括文献基本信息（标题、作者、发表期刊、发表时间、DOI）、实验信息（实验模型、样本类型、检测技术）及组学信息对应的实验结论等。（三）主要任务内容 1.文献采集与预处理：采集近20年涉及《古代经典名方目录》中具体经典名方的中英文文献，完成去重、格式转换、OCR识别（如有）、元数据标引等工作，建立原始文献库。 2.组学信息实体识别与关系抽取：设计并实现针对中医药文本特点的命名实体识别（NER）模型，精准识别核心组学实体；构建实体间语义关系抽取模型，提取关键关联关系。 3.知识结构化与数据库建设设计符合中医药逻辑的数据模型，构建“经典名方－药材－组学靶点－通路－疾病”五维关联图谱。开发数据库管理系统，支持多维度检索与数据导出（JSON、CSV、Excel等格式）。 4.功能开发采用B/S架构，实现Web端信息抽取与展示，具备文献上传与批量解析、抽取结果人工校对与反馈闭环、可视化网络图展示、数据统计分析、权限管理与日志记录等功能。三、技术要求 1.支持语言：以中文为主，兼容英文文献； 2.NER准确率：≥90%（测试集人工标注验证）； 3.关系抽取F1：≥85%； 4.单篇文献处理时间：≤30秒（平均）5.数据库容量：支持≥10万条结构化记录存储； 5.系统响应时间：≤3秒，支持≥50人并发操作； 6.平台可用性：Web界面友好，连续72小时无故障运行。
参考链接
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